文献阅读

所学即学其所用，所用即用其所学。（清）李塨

这是我们开始的第一步。通过阅读别人的文章来明确我们可以做什么，要做什么。

查找文献

PubMed和Web of Science是两个常用的检索网站。

当然，检索也支持"AND", "OR"这样的运算符，我们可以自己试试。善用运算符可以帮助我们聚焦我们关心的问题

善用运算符缩小范围

大部分搜索引擎（应该是全部）都支持运算符。这个东西大家应该都会。

也就是AND、OR、NOT三个符号。不过在检索文献时我从来没有用过NOT。对于多个关键词的我们可以用引号"来包裹，表示这是一个完整的词。

这么多相关的文章也不是都对我们的工作有指导作用，我们要浏览标题。以MADS为例，我们发现有些是研究某个基因的功能的、有些是对基因家族进行研究的，有些是研究线粒体的（这个领域也有一个叫MAD的缩写）。显然从中可以看出我们要关心的是对基因家族进行的研究。我们可以改写一下检索，加入"genome"关键词。用genome AND MADS去检索。发现结果一下少了许多，我们可以进一步完善关键词缩小范围。

对于搜索结果一般选择按时间排序，10篇左右就可以对要做的事有一个基本了解，当然能看到15篇就足够了。“吾生也有涯，而知也无涯。以有涯随无涯，殆已！”

有人问：难道不需要找一些、看一些相关的经典文献吗？这里有两点，一是你不知道哪些是经典，以MADS为例，mads的名称来源于4个物种，那么在这些研究里显然它们还不叫mads，论文的标题里也不会有MADS。二是有些经典也不一定是拿来看的，现在没有任何一个大学物理系学生是通过看《自然哲学之数学原理》来学习物理的。他们看的是教科书，教科书才是教学生的；《自然哲学之数学原理》是牛顿用来炫耀自己水平的。

那么我们就无视这些经典了吗？当然不是，这些经典不是我们自己找出来的，是通过阅读他人文献让他们来告诉我们的。在他们的introduction中会介绍研究的背景，这时候他们的引用就是我们的参考。

筛选好文献后就可可以使用导出文献信息，将文章列表导入文献管理软件，这样的好处是之后写文章较为方便。具体用法参看环境配置及相关软件部分

阅读

这一步我们也不需要看全文，现在我们的目的是了解背景，看看要做的工作。所以只需要看introduction和methods这两个部分再加上作为结果的图片就可以了。results和discussion这两个部分在我们写论文时再看。当然，review是需要认真一点看的。

看introduction可以对我们的背景有一个基本了解。例如对MADS基因家族进行分析，文章都会讲到这个基因家族的一些基本信息，通过阅读获取这些信息。

看methods和图片可以了解他人做了哪些，以及对照自己的情况，得出自己可以做哪些。

introduction阅读

看的时候也可以省点事，以我们的基因家族分析为例，发现大部分的introduction都是这样的套路：

• 我们的植物是什么，有什么价值
• 我们研究的基因家族是什么，怎么发现的，对植物生长、发育、繁殖有什么作用
• 目前该物种的该基因家族还没有研究，我们进行了研究得出了一定的成果，对该物种生长、发育、繁殖有作用

这样的话我们就不用关心他们研究的物种了，对我们没有价值。我们重点关心一下我们的基因家族的相关信息。

material and methods阅读

留意一下他们用的工具就行了，毕竟他们也没有手把手教我们怎么做。还是需要自己看文档、并不断尝试。

Tips

• web of science学校买了，需要通过校园网或VPN访问

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